考取中国科学院上海应用物理研究所的研究生整体来说较为容易，并未列入全国最难考的100所大学之列。学校的地理位置、声誉以及排名等因素，均会对考研的难易程度产生影响，因为不同地区的报考人数会有所差异，导致竞争强度也不尽相同。通常而言，在经济更发达的地区，报考的学生更多，因此这些地区的重点高校往往较难考取，而非重点高校则相对容易一些。

在物理学领域表现出色的高校包括清华大学、北京大学、上海交通大学、复旦大学、南开大学、南京大学、浙江大学、武汉大学、厦门大学及中国科学技术大学。