根据研究生点的数量和学校的排名，共有15所院校入选：中国科学技术大学、合肥工业大学、安徽大学、安徽师范大学、安徽农业大学、安徽医科大学、安徽理工大学（这7所均设有博士点），安徽工业大学、安徽财经大学、安徽中医药大学、安徽工程大学、蚌埠医学院、皖南医学院、淮北师范大学、安徽建筑大学（拥有硕士点但没有博士点）。

主要包括以下学院：经济学院、法学院、社会与政治学院、马克思主义学院、外国语学院、新闻传播学院、商学院（学术型硕士及会计专业硕士）、管理学院（全日制）、艺术学院、物理与光电学院、化学化工学院、生命科学学院、资源与环境学院、电子信息工程学院、计算机科学与技术学院、物质科学与信息技术研究院、联合培养项目（与中国科学院合肥物质科学研究院合作）、集成电路学院、材料科学与工程学院、大数据与统计学院。